2024年3月15日星期五

這個基因,讓細胞「攜帶記憶重生」!

來源:中國科普博覽


如果讓你帶著現在的記憶重生到童年,你會選擇記住當年的高考答案,還是某期彩券的開獎號碼呢?這種「攜帶記憶重生」的橋段也成為了許多網路小說的主題。雖然對整個人來說這還只是幻想,但是對於單一細胞來說,這個幻想已經變成了現實!

2023年10月12日,中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組,聯合中國科學院北京基因組研究所張維綺課題組、任捷課題組,在《細胞-幹細胞》( Cell Stem Cell)上,線上發表了題為Genome-wide CRISPR activation screening in senescent cells reveals SOX5 as a driver and therapeutic target of rejuvenation的研究論文。在論文中,作者報告了新發現的SOX5基因,可以讓細胞在不改變細胞身份(攜帶自身「記憶」)的前提下發生細胞更生,讓已衰老的細胞重新年輕活化。

這項發現為研究細胞老化過程、治療老化相關的疾病等問題提供了新的研究想法。那麼,這基因是如何被發現的呢?它對細胞的更生又有哪些重要意義呢?

圖1 文章標題截圖(圖片來源:cell)

抗衰之路的曲折探索

人體是由細胞組成的,人的衰老與人體細胞的衰老密不可分。細胞在執行生命活動過程中,隨著時間的推移,細胞增殖與分化能力和生理功能逐漸衰退,細胞內基因、蛋白質細胞器也會發生顯著的變化。細胞不再像年輕時那樣充滿活力,各種反應速度減慢,導致整體的生理功能也發生退化。

細胞老化與身體的衰老及疾病等有重要關聯,深入研究細胞老化現象,有助於預防及治療相關疾病。因此,科學家很早就開始研究細胞老化過程中的分子生物學,試圖開發逆轉老化的方法。簡單地說,就是讓細胞得以「返老還童」 ,重新恢復活力。

此前,中國科學院動物研究所劉光慧研究員及合作者,利用最新的體細胞重編程技術,成功逆轉了兒童早衰症患者身體中已經衰老的成纖維細胞。

兒童早衰症是一種罕見的遺傳疾病,患者在嬰幼兒時期就表現出皺紋、掉髮、動脈硬化、身體虛弱等一系列老年症狀,並通常在13歲之前死於各種老年病。這種病的原因是基因突變導致的全身細胞的過早而不可逆的衰老。

圖2 兒童早衰症患者(左圖),正常人類細胞核(右上)以及兒童細胞核(右下)(圖片來源:參考文獻2)

劉光慧研究員團隊成功使得患者的成纖維細胞發生"時光倒流",採用的方法是向細胞中註入"山中四因子",這是2012年諾貝爾獎獲得者山中伸彌發現的4個轉錄因子——Oct4 、Sox2、Klf4、c-Myc(合稱OSKM),能夠使細胞發生時鐘逆轉。

雖然最後的結果是患病細胞的衰老得到了逆轉,但「山中四因子」在治病的同時也帶來許多風險。其中最大的問題是,山中四因子在使細胞「返老還童」的同時也一併擦除了細胞的分化狀態,改變了細胞​​身份。重編程後的細胞雖然重獲新生,但它也失去了自己的記憶。

也就是說,細胞雖然「返老還童」了,但是徹底成為了無知懵懂的小孩子,不知道自己肩負的生理功能是什麼了,雖然重新變得年輕,但卻忘了自己肩負的責任。

圖3 山中因子在體細胞重新編程中的作用(圖片來源:參考文獻3)

還有一個問題是,國際上許多科學家都在動物身上嘗試使用山中因子來抗衰老,可是許多實驗動物後來都死於腫瘤或癌症。看來,想用這招來對抗衰老,還有很多問題要解決。
重新評估實驗後,劉光慧研究員團隊認為,山中因子可能還有些問題。於是,他們踏上了尋找新的「老化逆轉基因」的道路。

這次要尋找的新基因需要有以下幾個特點:首先,能讓細胞重新年輕;其次,在變年輕的同時不能抹掉細胞的記憶,要讓它記得自己的功能;最後,盡量保證安全,不要產生太大的風險。

從頭求索,再尋「重生」基因

既然要做,那就做到徹底。劉光慧研究員團隊以自建的人間充質前驅細胞體系為材料,對細胞裡的兩萬多個基因逐一進行排查,看看到底哪些基因能夠起到延緩衰老的作用。

這個篩檢過程應用了一種稱為「 CRISPR活化」的工具。 CRISPR本來是一種常見的基因編輯工具,經過改造後,這項工具可以為特定的基因帶去活化因子,使其發生功能增強。劉光慧研究員團隊向細胞中的兩萬多個基因逐一發送增強指令,觀察增強哪些基因可以發揮細胞更生的作用。

經過一番刻苦的檢查,團隊成功鑑定出了一系列的基因,這些基因在激活後,可以充分發揮延緩人間充質前體細胞衰老的效果,因此,這一系列的基因都是我們對抗細胞衰老的潛在秘密武器。

而在這些基因當中,有一個基因獲得了科學家的重點關注,這就是SOX5基因。從名字就可以看出,SOX5與山中因子裡的SOX2是同一基因家族裡的基因,而SOX5的活化表現出了很強的促細胞年輕化的能力。於是,科學家圍繞著SOX5進行了一系列後續驗證。

抗衰功能驗證"三重門"

要證明一個基因有抗衰老的功能,需要三個方面的線索:在分子層面上,我們要找到基因互作的證據,也就是這個基因會跟哪些基因相互影響;在細胞層面上,我們要看到這個基因對於細胞老化的逆轉;在生物個體層面上,我們需要證明這個基因真的可以使老化的生物器官重新年輕化。

在這幾個層面上,SOX5基因都沒有讓我們失望。

首先,在分子層面上,綜合運用多種篩選技術後,科學家找到了SOX5的「接頭下家」— HMGB2基因,這個基因在先前的研究中被證明是一個老化抑制基因。 SOX5可以活化HMGB2的表達,從而啟動細胞的更生進程。研究也發現,如果抑制了細胞中的SOX5基因,那麼HMGB2的表達也會受到抑制,細胞會加速老化。因此,SOX5發揮作用的分子機制得到了證實。

圖4 SOX5基因是其他基因的遠程增強子(圖片來源:參考文獻1)

其次,在細胞層面上,SOX5的表現如何呢?實驗發現,SOX5確實能夠讓很多種的衰老人類細胞重新年輕化,難能可貴的是,這種年輕化不是簡單地"時光倒流",而是在返老還童的同時沒有改變細胞的身份,就相當於讓這些細胞在維持記憶的前提下重生了。

最神奇的是,SOX5基因真的可以在老鼠的身上起到「返老還童」的功能!為了研究SOX5基因在個別老化中的功能,研究團隊選擇了一群老年小鼠,在它們的膝關節中進行了SOX5基因治療。老年小鼠的膝關節往往會有骨贅和滑膜增生、發炎、軟骨磨損等老化現象,而經過SOX5治療的小鼠膝關節中,骨贅和滑膜再生受到了顯著抑制,而軟骨再生能力也得到了增強,最重要的是,經過治療後,老年小鼠的肢體抓力也獲得了顯著提升。看來,SOX5基因真的讓這些「鼠爺爺」的腿腳重新年輕了一次。

圖5 以SOX5基因為老年小鼠進行關節治療年輕化效果明顯(圖片來源:參考文獻1)

當然,這種為老年小鼠治療關節的事,山中四因子也能做,但是SOX5有兩個優勢是山中四因子比不了的:首先,SOX5不會導致細胞分化痕蹟的擦除,也就是說不會改變細胞身份,細胞仍能維持原有的「記憶」;另外,相較於山中的四份基因來說,SOX5是單獨作戰, DNA長度更短,引起的副作用可能會更少一些,治療中也就更安全一些。

總的來說,這項研究為我們找到了一系列全新的細胞更生因子,對這些基因的研究將為我們對抗老化帶來新的可能性,也進一步加深了我們對細胞老化過程的理論認知。而SOX5這一特殊基因由於其優異的特性,可能成為對老化相關的退化性疾病進行幹預的潛在標靶。

參考文獻:

[1] Yaobin Jing, Xiaoyu Jiang, Qianzhao Ji, Zeming Wu, Wei Wang, Zunpeng Liu, Pedro Guillen-Garcia, Concepcion Rodriguez Esteban, Pradeep Reddy, Steve Horvath, Jingyi Li, Lingling Geng, Q. Izpisua Belmonte, Jie Ren, Weiqi Zhang, Jing Qu, Guang-Hui Liu,Genome-wide CRISPR activation screening in senescent cells reveals SOX5 as a driver and therapeutic target of rejuvenation,Cell Stem Cell,Volume 30,0130, 303,031,031,031, 3013203930,030 1452-1471.e10,ISSN 1934-5909,https://doi.org/10.1016/j.stem.2023.09.007.

[2] Scaffidi P, Gordon L, Misteli T (2005) The Cell Nucleus and Aging: Tantalizing Clues and Hopeful Promises. PLoS Biol 3(11): e395. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0030395

[3] Chiavellini P, Canatelli-Mallat M, Lehmann M, Gallardo MD, Herenu CB, Cordeiro JL, Clement J, Goya RG. Aging and rejuvenation - a modular epigenome model. Aging (Albany NY). 2021 Feb 24; 13: 4734-4746 . https://doi.org/10.18632/aging.202712

作者:牧心

本文源自「科學大院「公眾號,轉載請註明公眾號出處




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